宜定期预防，忌人防我防。鱼类发病都有一定的周期性。如初春、晚秋低水温期鱼类易发水霉病，初夏、中秋易发草鱼及青鱼的老“三病”，夏季高水温期则是暴发性鱼病的高发季节。根据鱼病发生的这种规律性，可以超前预防。
宜综合预防，忌单一用药。鱼类发病是综合因素作用的结果，因而预防鱼病必须针对各类致病因子、采取综合措施，抑制病原体，改善水环境，提高鱼体抗病能力。包括彻底清塘、鱼种消毒、定期注水和施用生石灰、科学施肥与投饵，定期内服外治等。
宜低温消毒，忌高温药浴。药浴是防治鱼病的重要方法，一般都在低温季节放养鱼种时，在木桶或木盆里进行，夏季采用这种方法，由于水温高，药物作用增强，危害性很大。
宜轮换用药，忌单一用药。水体中如单用一种药物防病治病，鱼类的各种致病菌和寄生虫会产生抗药性，降低用药效果，应积极推广轮换混合用药，但酸性药物和碱性药物不应混合使用。
宜择时用药，忌随时用药。鱼药的使用效果，尤其是全池泼洒药物的使用效果与水混、溶氧、光照等有密切的关系，水温高、溶氧丰富、光照强，可以加快用药生效速度和提高药效，减轻用药副作用。因而防治用药宜在晴天午后进行。
宜适量用药，忌乱加药量。各种鱼药用量都是经多次试验后确定的，可有效地防治鱼病，且副作用小。如过量使用，不但加大了成本，而且有可能造成药害。
宜选用非金属容器贮溶药物，忌用金属容器。鱼药大都是化学合成药物，化学性质不太稳定，易与金属发生化学反应，成分和性质都发生变化。因此贮存、溶化鱼药应选用陶瓷、木材、塑料等非金属材料制成的容器。