卵巢囊肿是指在卵巢上形成囊性肿物，数量为1个到数个，其直径为1厘米至几厘米，卵巢囊肿主要是卵泡囊肿和黄体囊肿两种。另外，卵巢囊肿也可表现为子宫内膜性囊肿，包含物性囊肿和卵巢冠囊肿。
1、卵泡囊肿。是最常见的一种卵巢囊肿，多见于牛、猪和狗，卵泡囊肿通常是后天性的，其发生原因不十分清楚，一般认为与促卵泡激素分泌过多和黄体激素分泌不足有关，一些影响排卵过程的因素，如饲料中缺乏维生素A或含多量雌激素，激素制剂使用不当，子宫内膜炎，胎衣不下，以及卵巢其他疾病等均可促进卵泡囊肿的发生。
眼观，囊肿卵泡比正常卵泡大，呈单发或多发，见于一侧或两侧卵巢。与核桃或拳头大小相当，牛的囊肿直径多为3-5厘米，囊肿壁薄而致密，内充满囊液。有时囊肿破裂后引起出血，血液流入囊泡内形成血肿，血肿被增生的内芽组织机化则形成结缔组织团块。镜检时，可见卵泡的颗粒细胞变性减少，在基部仅留少量颗粒细胞，甚至完全消失。卵泡壁结缔组织增厚，卵细胞坏死消失，卵泡液增多。卵泡囊肿时，同时见子宫肉膜肥厚，腺体增生并分泌多量黏液蓄积于腺腔内，内膜表面覆黏液与脱落破碎上皮细胞混合物，呈脓样。发生卵泡囊肿时，常伴发脑垂体，甲状腺和肾上腺增大，有时会继发乳腺肿瘤。
2、黄体囊肿。是由于黄体囊状化形成的囊肿，多发生于单侧，大小不等，囊腔形状不规则并充满透明液体。其破裂后可引起出血，在囊腔内形成血样液体。镜检，见囊肿壁多由多层的黄体细胞组成，其细胞浆内含有黄体色素颗粒和大量脂质。有时黄体细胞在囊壁分布不均。一端多而另一端少，当囊壁很薄时，贴有一层纤维组织或透明样物质的薄膜和多量黄体细胞。发生两侧性黄体囊肿时，常为多发性小囊肿。当未排卵的卵泡壁上皮细胞黄体化时也可发展为黄体囊肿，也称黄体化囊肿或黄体样囊肿。囊肿常呈圆球形，囊壁光滑，缺乏正常动物排卵小泡黄体化产生的排卵乳状。黄体囊肿可见于牛、马、驴、猪、狗等动物。其发病机理目前仍不十分清楚，一般认为与黄体的功能异常有关。
3、子宫内膜性囊肿。子宫内膜在子宫以外的组织器官种植，引起子宫内膜异位症。当子宫内膜种植到卵巢时，形成子宫内膜性囊肿，其囊壁由子宫内膜上皮细胞组成，囊腔内充满棕褐色的物质，内含血源性色素，所以也称巧克力囊肿。该种囊肿的发生主要是由于脱落的子宫内膜上皮细胞经输卵管反流入腹腔，种植在卵巢引起。子宫内膜异位症也可见于腹膜，肺等组织器官。
4、包含物性囊肿。此种囊肿少见，多发生于老年动物。其发生是由于卵巢表面的一部分上皮细胞被包埋在卵巢基质中，并被分割形成一些小的囊肿，当其数量多时，卵巢的切面呈蜂窝状。镜检可见囊肿由一层扁平上皮细胞形成。
5、卵巢冠囊肿。主要见于卵巢系膜和输卵管系膜之间，其大小为1厘米至几厘米，单个或多个分布。镜检见囊壁由单层扁平上皮，立方上皮或柱状上皮细胞组成。此种囊肿的发生是由于胚胎时的中肾残留管扩张形成的，由于中肾管发育成为卵巢冠纵管，故有时卵巢冠囊肿也称为卵巢囊附件。在草食兽，水泡涤虫（细颈囊尾蚴）的囊泡易与此种囊混合，应根据囊内是否有头节进行鉴别。
6、病因。卵巢囊肿是引起奶牛不孕的最常见的原因之一，其经典定义是不排卵的卵泡持续10天或更长时间，直径大于2-5厘米并导致不发情或成为慕雄狂。而目前发现部分卵巢囊肿的母牛，不排卵卵泡的直径小于2-5厘米，并且不发情的比慕雄狂要远远普遍得多。
引起卵巢囊肿的原因有很多，如含高雌激素的饲料或雌激素药物，引起皮质醇升高的应激，硒缺乏或饲料中可溶蛋白水平过量等。子宫内膜炎是导致卵巢囊肿的诱因，另外，干乳期过肥的牛在下一个泌乳期也易发生卵巢囊肿。
因此卵巢囊肿可能是环境和遗传2个方面原因造成的。可能包括子宫健康状况差，营养或矿物质不均衡，慢性生殖道感染，应激、激素的相互作用和其他因素。
7、症状。慢性卵巢囊肿造成雌激素诱导的身体结构及行为的变化，如骨盆韧带松弛、外阴和会阴肿胀，尾根抬高（慕雄狂），颈部增厚、过肥或阉牛外观等。
8、诊断。根据临床症状即可确诊。单纯通过直肠检查不易区分卵泡性囊肿和黄体性囊肿，运用超声扫描术和测定血液黄体酮水平诊断更为准确。
9、治疗。多数卵巢囊肿需要治疗，人工挤破囊肿易造成纤维化、粘连或出血，所以不宜采用。
治疗卵巢囊肿的药物包括：促性腺激素释放激素、人绒毛膜促性腺激素和前列腺素等。
为使治疗过的母牛尽快发情，需在注射促性腺激素释放激素后9-12天进行直肠检查，假如已形成明显的黄体，可用前列腺素诱导发情。禁止在产后早于9天就注射前列腺素，这样可能促成卵巢囊肿再度发生。
前列腺素可能是治疗黄体性囊肿的惟一药物。根据黄体酮水平的测定，使用前列腺素对黄体性卵巢囊肿进行特效治疗可快速恢复发情。
除了特效治疗卵巢囊肿之外，也应治疗同时发生的生殖道异常，如子宫内膜炎。当一个牛群卵巢囊肿的发病率比预期的要高时，应当评估牛的营养状况和其他的管理因素。