柑桔采收后在贮藏过程中，可发生20多种病害，其中传染性病害最先是青霉病，而后是绿霉病，中后期还有炭疽病、蒂腐病、黑腐病等，生理病害有水肿病、褐斑病（也称干疤病）等。现根据柑桔贮藏期的主要病害及其发生规律，提出柑桔贮藏期病害综合防治技术。
1、采前喷药：果实采前10天左右喷1-2次杀菌剂，降低病原基数。一般可喷70%甲基托布津可湿性粉剂1200-1500倍液或50%多菌灵可湿性粉剂1000倍液。
2、适时采收：贮藏果实，根据贮藏期长短适当提早采收，果实成熟度掌握在八成左右。过早或过晚采收均不利于贮藏。
3、合理采摘：柑桔果实采收时必须坚持"采收十大注意"（即霜、露、雨水未干不采收；选黄留青、分批采摘；采果时须剪齐指甲或戴上手套，以防伤果，并先外后内，先下后上，要求采用复剪法，果蒂剪平，防剪刀伤；果筐内须放柔软物，轻拿轻放；伤果、落地果、粘泥果及病虫果必须分开堆放等）,在采收、装运及贮藏过程中都要防止果实遭受人为和机械损伤，以杜绝病菌从伤口侵入、降低发病率。
4、药剂处理：采后及时用药浸果处理，最好边采边浸果处理，最迟不超过24小时。
5、通风预贮：经防腐处理的柑桔要放在通风库房预贮，一般预贮5-7天，如遇雨天，可延长到10-12天，通常以果皮晾干、果实失重3%-5%为度。
6、贮库消毒：果实进库前，库房要进行熏蒸。每立方米用硫磺粉5-10克点火烟熏1-2天或用福尔马林40倍液，每立方米30-50毫升，密闭熏蒸3-4天后，待药气散后方可入库贮藏。控制库房温度和湿度。温度要求3-4度，相对湿度80%-85%.并注意适当通风换气。
7、单果包装：贮藏最好采用农用聚氯乙烯薄膜单果包装。
8、防腐保鲜：常用的防腐剂有多菌灵（10%、25%、50%三种剂型）、托布津（25%、50%、70%三种剂型）;保鲜剂为2,4-D（人工合成的植物生长调节剂，原粉为白色，加工剂型有2,4-D丁酯、钠盐及铵盐）;防腐保鲜剂具有保腐和保鲜的作用，但只能短期贮存（春节后即销售或食用）,效果好的还是自制多菌灵（或托布津）+2,4-D丁酯（或粉剂）.
如果是甜橙类，一般25%的多菌灵用500-1000倍，常用500倍；70%托布津用700-1000倍，常用800倍；72%的2,4-D丁酯200-250ppm.配方：50公斤水+70%托布津0.12斤+72%2,4-D丁酯18-20毫升。如浸果量不大时，可用15公斤水+72%2,4-D丁酯5毫升+0.08斤多菌灵（或0.04斤托布津）浸果。
若无2,4-D丁酯，可用2,4-D钠盐（先用80度左右热水溶解）代替：1克85%2,4-D钠盐+4公斤水+5克70%托布津（或8克25%多菌灵）.
对于宽皮类，可用2.5%小苏打40-50倍加200ppm 2,4-D液浸5-10分钟，可贮藏120天，配方：50公斤水+2.5%小苏打1公斤+72%2,4-D丁酯13毫升。或者25%多菌灵500倍+72%2,4-D丁酯50-100ppm.配方：50公斤水+25%多菌灵0.2斤+72%2,4-D丁酯5.5亳升。