冷藏 将选好的蒜薹经过充分预冷后，装入筐、板条箱等容器内，或直接在贮藏货架上堆码，然后将库温控制在0℃左右。若将蒜薹每10千克左右装入聚乙烯袋中，再堆放在货架上，效果会更好。在0℃～0.5℃和95%相对湿度下，蒜薹可贮3～4个月。
气调贮藏 常温下蒜薹气调可贮1个多月，在低温库内，气调冷藏则能贮藏8～10个月。因此，目前最主要的贮藏方式是冷库中用塑料薄膜袋贮藏。具体方法是：将整理好的蒜薹装入100厘米×75厘米的聚乙烯薄膜（厚0.06～0.08毫米）袋内，每袋装15～25千克。若未经预冷，则应先敞开袋口，待充分预冷后再扎紧袋口。这种方法因袋数过多不能每天逐袋调节气体成分，只能采取定期放风管理的办法。贮藏前期（即6～8月）可半个月换一次气，贮藏中期（9～11月）可10天换一次气，贮藏后期（12～1月）可7天换一次气。每次换气时须上下抖动口袋，同时应擦去塑料袋内壁的水，及时抽出烂条。