油菜籽是我国主要大宗油料资源，搞好油菜籽的贮存，可以减少浪费，提高效益。根据各地在实际贮存中积累的经验，对于新收获的油菜籽应进行分级贮存，具体方法如下：
含水分在9%以下、杂质含量不超过3%的油菜籽，适宜于较长期贮存。因此，在散存的情况下，其堆高以1.8-2.3米为宜；采取包装贮存时，堆码以12个包高为宜。
对那些水分含量在10%-12%的油菜籽，仅能短期贮存。水分含量在12%以上的油菜籽必须进行整晒后再贮存。值得注意的是：菜籽在整晒时，必须掌握方法，即须待晒场晒热后才能铺场晾晒，否则，菜籽易变质，捏碎无油、籽仁呈暗绿色都是变质的具体表现；晾晒后的菜籽，还必须使其热量散发并凉透后再入库，否则，会形成“干烧”，严重影响菜籽的出油率和油的品质。
油菜籽的另一种贮存方法是通风降温贮存法。这种方法的要领是通过通风来达到降低油菜籽的贮存温度和贮存水分。但通风必须结合气温与湿度的情况来进行曲，切忌盲目操作。据测定，油菜籽贮存在相对湿度为80%的环境中，菜籽自身水分的上升回潮一般在10%左右。因此，贮存环境的相对湿度越大，菜籽越容易发生变质霉坏。菜籽在贮存过程中除了应注意通风外，也不能忽视环境的密闭防潮保持干燥和低温。