疫腐病的发生与温、湿度关系密切，每次降雨后，都出现发病高峰。果实生长期雨水多的年份发病重，高温、多雨天气则会引起病害流行。在土壤积水的情况下，果树根颈部如有伤口，病菌则会侵入皮层，造成根颈部腐烂。品种间抗病性有差异，红星、金冠、印度、祝光等发病较多，伏花皮。红玉、倭锦等也易染病，国光、富士、乔纳金等品种发病较轻。
（2）防治措施：
①加强果园管理。随时摘除树上的病果和病叶集中深埋并清除地面落果，以减少菌源。及时排水防涝，中耕除草，以降低果园湿度，可减少发病。适当提高结果部位或地面覆盖草、薄膜可起到防止土壤中病菌向上侵染果实的作用。
②喷药保护。重点喷药保护树冠下部的果实和叶片，常用药剂有1：2：200波尔多破或80％乙磷铝可湿性粉剂700倍液、70％代森锰锌可湿性粉400-500倍液。
③刮除病斑。根颈部发病的植株，于春季扒土晾，刮除腐烂变色的部分，用40％福美砷可湿性粉剂50倍液或波尔3-5度石硫合剂消毒伤口。换无病新土培根部，培土要高于地平面，以利于排水。必要时，可采用桥接恢复树势。