辣椒整个生育期均可发病，主要危害叶片和果实，成熟的果实和老叶易受害。叶片受害，叶缘出现近圆形水渍状褐斑，病斑中间淡灰色，其上有轮生小黑点（病菌分生孢子盘）。果梗受害，产生褐色不规则凹陷斑，干燥时易开裂。果实受害后易干缩，病斑呈膜状，易破裂。
辣椒炭疽病病菌发育适温为27℃、相对湿度为95％左右。雨季来得早、温湿度适宜时，病害易发生和流行。病菌从伤口侵入，通过风雨及蚜虫、叶蝉等刺吸式口器害虫传播危害。栽植密度大、偏施氮肥、排水不畅、通风透光性差，会加速病害流行。夏季高温干旱、日灼严重，易加重后期病害流行。重茬地或清园不彻底的田块菌源充足，发病重。品种间抗病性差异大，通常线辣椒比甜辣椒易感病。
防治辣椒炭疽病，应采取综合措施。（1）种子消毒。用农抗120 4%嘧啶核苷类抗菌素水剂100倍液浸种12小时，捞出晾至半干后播种；也可以先用凉水预浸1～2小时，再用55℃温水浸10分钟，然后放入冷水中冷却，催芽播种。（2）与麦类、玉米等禾本科作物实行2～3年轮作。（3）加强栽培管理。根据品种特性和肥水条件合理密植；棚室及时通风排湿，避免高温高湿；雨后及时排水，及时清除病残株；增施磷钾肥，提高植株抗病能力。（4）药剂防治。发病初期选用农抗120 4%嘧啶核苷类抗菌素水剂600倍液，或2％武夷菌素水剂200倍液，或炭疽福美80％福·福锌可湿性粉剂800倍液，或75％百菌清可湿性粉剂600倍液喷雾防治，每隔10～15天一次，连续防治3～4次。