乳酸菌奶饮料和普通的乳酸饮料、酸酸乳饮料有本质区别，主要体现在：
1.营养价值不同。在营养方面，发酵奶和勾兑奶差异最大：发酵奶经过发酵，含有大量乳酸菌及肽、氨基酸、小分子脂、活性钙、镁、磷、单糖、半乳酸等营养物质，对人体有保健作用；而勾兑奶不含乳酸菌，没有小分子营养及活性元素，人体吸收率低，营养价值低。
2.生产工艺不同。乳酸菌奶饮料是发酵产品，而乳酸饮料、酸酸乳饮料等属于调配产品。发酵型乳酸菌奶饮料是利用优质的牛奶经过乳酸菌发酵，会产生大量对人体有益的乳酸菌和乳酸菌有益代谢产物，具有乳酸菌及发酵产物的生物功能，是有益健康的理想奶饮品；而普通的乳酸饮料则是以水、牛奶、白糖、柠檬酸或乳酸等配制而成的，工艺简单，不经过发酵，产品中没有乳酸菌及乳酸菌的代谢产物，乳糖也未降解，因此只属于乳饮料或乳酸饮料，营养价值及功能低于发酵型乳酸菌奶饮料。
3.口感有差异。从口感角度比较，发酵奶和调配奶有明显差别：发酵奶奶香自然、口感醇厚、天然酸甜、回味无穷；而勾兑奶口感偏淡、偏稀，有酸涩感，有香精味。
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