农委会拟将鸡蛋芬普尼残留标准从5ppb上修至10ppb，但食药署认为农委会未对10ppb的来源提出科学依据，应厘清环境中有多少芬普尼残留可能污染到蛋鸡场。对此，农委会表示，其实该有的资料都有，建议农委会跟食药署的专家会议可联合召开，避免各说各话。
台湾并未订定鸡蛋芬普尼残留标准，因此依规定是不得检出，而机器检验最低值是5ppb，因此暂以5ppb为标准，由于台湾93％饲料都来自进口，加上国外作物可使用合法芬普尼，导致进口饲料中可能也有芬普尼残留，让鸡只吃下肚，对此，农委会拟将标准提高至10ppb，让农民有标准可遵循。
不过卫福部食药署的谘询委员认为，虽然10ppb的数字对每人每日可摄食的容许量不会有太大问题，但农委会并未详细给予芬普尼在环境中的背景值让10ppb的标准失去科学依据，加上先前卫福部长陈时中也认为不该放宽，让外界解读卫福部打脸农委会。
农委会主委林聪贤表示，农委会虽然致力推动农药减量，但很多环境背景都会有农药残留，现在检测都很灵敏，只要一有化学反应，都会显示在图谱上，因此不得检出的标准对农民相当不利，农方权责就是要保护生產者，在合理的残留标准下让农民做好品质管理，其实农委会也有田间试验各种残留状况的资料可供食药署做风险评估，未来希望农委会的专家会议和食药署的专家会议可以一起开，让资料彼此串接，不要各说各话。
林聪贤指出，台湾高达93％的饲料都仰赖进口，一时难以找到替代，加上农民可能受到临田污染，发生问题可能要一直打官司，实在不利。
立委张丽善表示，本次农委会对全台1400多家蛋家场进行芬普检测，最后不合格者有40几家，占整体比例约3％，只因为3％不合格的蛋农，就要放宽标准，将產生劣币驱逐良币的情况，农委会应厘清芬普尼源头究竟来自哪里，以及要如何监控，对协助农民和消费者提出解方。
