整治行动的具体措施有四：一是开展拉网式排查工作。以农村地区、城乡接合部为重点，全面检查农村集贸市场、校园及其周边食品摊贩、食品店（小卖部）有无销售“四类”不安全食品的行为。对检查发现的“四类”不安全食品要依法采取停止销售，查封下架，没收违法所得和违法经营的食品，没收用于违法经营的工具、设备、原料等物品，处以罚款等措施。情节严重的，吊销食品经营许可证；构成犯罪的，移送司法机关处理。二是对问题食品追根溯源。对排查发现的问题食品，追查其来源和渠道，调查摸底加工制作 “黑窝点”和中间供应商的具体单位、个人和地址。三是组织联合查处“黑窝点”。发挥本部门监管职能“环节合一”和食品安全办综合协调的职能优势，开展跨环节、跨区域、跨部门联合行动。四是对违法犯罪行为进行严厉打击。严厉打击无证经营行为，规范食品生产经营者的主体资格。打击销售、使用无合法来源食品和原料的违法行为，规范食品生产经营者的采购活动。打击生产经营“四类”不安全食品违法行为，规范食品生产经营过程。
整治行动还强调各地要强化案件查办工作，始终保持严查重打的高压态势，做到深挖彻查，加大对农村食品市场大案要案的线索排查和查办力度。对大案要案实行挂牌督办，限期办结。同时，加强行政执法与刑事司法的衔接，对涉嫌犯罪的案件，及时移交公安部门。
