当晚,辽宁、吉林两省粮食局按照国家粮食局和省人民政府的部署要求,连夜研究分析案情,制定核查方案,抽调得力人员,4月18日即分别派出由局领导带队的核查工作组,赴辽宁铁岭开原、吉林松原前郭等地开展实地核查,即刻封存涉案粮食,依法控制关键涉案人员,查清问题真相,严肃追究有关企业和人员的责任。中储粮总公司也及时派员到两省的涉案企业进行核查处理。同日,由国家粮食局监督检查司司长赵文先带队的2个核查督办工作组分别赶往辽宁、吉林两省,对核查工作进行指导和督办。
国家粮食局决定,除严肃督办对央视曝光的辽宁、吉林有关企业进行彻查外,还将把东北三省一区收储的政策性粮食库存作为今年国家粮食库存检查的重点,同时,还要求正在进行年度粮食库存检查的各省区市粮食部门,都要高度聚焦、严厉查处国家政策性粮食收储和销售出库过程中的买陈抵新、先收后转、低收高转等各种转圈粮问题。国家粮食局要求各级粮食部门要从讲政治纪律、守政治规矩的高度,认真落实党中央、国务院关于粮食工作的大政方针和强农惠农富农政策,严格执行国家粮食收储政策,绝不允许任何单位和个人把中央的惠农政策、政策性粮食收储政策当作谋取小集团利益、捞取个人私利的手段,对违反政策纪律、损害国家利益、坑害农民和消费者利益的行为,要坚决严肃查处、决不姑息迁就。