美国：无标识、有争议
美国是全球最大的转基因作物种植国，用转基因大豆和玉米生产的食品早已遍布美国超市，也被消费者广泛食用。
在美国，超市货架上的转基因食品通常并没有特殊标识。美国联邦政府监管部门支持在食品包装上标注“转基因”标识，但不作强制要求。美国国会参议院今年５月明确驳回了强制标识转基因食品的要求，消费者也很少留意所购买的是否是转基因食品。
但今年６月，美国东北部的康涅狄格州成为第一个要求标识转基因食品的州。该州通过一项设置生效前提的法案，要求给转基因食品贴上“用基因工程技术生产”的标识，否则，违法卖家或分销商将面临每件商品每天多达１０００美元的罚款，相关食品可能还会被消费者保护部门禁售。
欧盟：转基因食品必须明示
和美国相比，欧盟对转基因作物和食品采取“谨慎批准”态度。欧洲转基因作物的种植面积在全球几乎可以忽略不计，转基因食品在欧洲市场的销售也非常有限，且有严格的规定。
根据欧盟规定，转基因食品在包装上必须有“转基因”标识，即便是散装的转基因食品，也必须在食品旁设置标识信息。
这也就是说，面粉、食用油等食品，如果原材料直接来源于转基因作物，必须明示；葡萄酒、卵磷脂等食品，如果含有来源于转基因作物的原材料，也必须明示。但也有一些食品是不用标识的，例如利用转基因微生物发酵制取的奶酪，转基因饲料喂养动物所产的肉、蛋、奶等。
在欧盟国家，凡是使用转基因原材料的食品不论其比例高低，均需标识。不过，对于加工非转基因食品的生产商，如果在加工流程中无意掺杂了进转基因成分，可以允许不超过０．９％的含量。
日本：三种标识方式
从２００１年４月起，日本就通过法规要求标识转基因食品。必须标识的包括大豆、玉米、马铃薯、油菜籽、棉籽、甜菜、木瓜８种农产品的转基因品种，以及用这些农产品为原料、能检测出转基因成分的加工食品，高油酸转基因大豆和转基因玉米为原料加工的食用油等。
相关的食品标识有三种：“转基因”“非转基因”和“转基因不分”。（ 根据日本的法规，和原有品种成分、营养价值等同的转基因农产品及其加工食品，如果能够检测出转基因成分，就必须标识为“转基因”或“转基因不分”；和原有品种成分、营养价值显著不同的转基因农产品及其加工食品，即使检测不出来转基因成分，也必须标识。
如果转基因原料在食品中不是前三位的主要成分、重量也不超过食品总重的５％，则可以不必标识；如果是转基因成分在加工过程中已去除、分解，使用最新检测技术也检测不出来的加工食品，也可以不必标识。
除以上８种农产品及其加工食品外，其他农产品及其加工食品都不允许标识“非转基因”，因为其他农产品并没有转基因品种，擅自标识“非转基因”可能使消费者产生误解。
