深海鱼中含有丰富的二十碳五烯酸（EPA）和二十二碳六烯酸（DHA）等Ω-3不饱和脂肪酸，这些都是人体必需的营养物质。其中，EPA可使血脉扩张，血小板聚集，改善血管通透性；DHA具有控制血脂的作用；两者都可以促进脑细胞发育，防止冠脉痉挛和动脉粥样硬化。
但深海鱼中有一种物质叫嘌呤，其含量远高于河鱼，且容易在体内代谢成尿酸，进而导致内分泌紊乱、血尿酸增高，还可能会引起痛风甚至痛风性肾病。
此外，海洋中也存在环境污染，包括重金属污染、难降解有机物污染等，海鱼必然会受到影响，人食用被污染的海鱼后，会对身体健康造成影响。
建议海鱼一周可吃两次，一次不超过半斤，烹饪方法以清蒸最佳。最好在做鱼之前先用清水泡一泡，因为鱼刚刚被杀死后，身上的细菌、寄生虫并没有完全死掉，浸泡一段时间后，能加速细菌死亡，并且鱼肉的口感也更好。
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