一.无机化合物的荧光分析
无机化合物除了钠盐等少数例外，一般不显示荧光。但很多金属或非金属离子可以与一有p电子共轭结构的有机化合物形成有荧光的化合物后，用荧光法测定：
1.直接分析法：形成配（鳌）合物
元素：Al、Au、B、Be、Ca、Cd、Cu、Eu、Ga、Ge、Hf、Mg、Nb、Pb、Rh、Ru、S、Se、Sn、Si、Ta (钽)、Th(钍)、Te、W、Zn、Zr等。
常用有机荧光试剂：8-羟基喹啉，安息香、茜素紫酱R，黄酮醇，二苯乙醇酮等。
二.有机化合物的荧光分析
荧光分析法主要应用于有机物、生化物质、药物的测定（200多种）；包括
有机化合物如：多环胺类、萘酚类、吲哚类、多环芳烃、氨基酸、蛋白质等。
药物如：吗啡、喹啉类、异喹啉类、麦角碱、麻黄碱等。
维生素如：维生素A、B1、B2、B6、B12、E、C、叶酸等。
甾体、抗生素、酶、辅酶等。
常见荧光试剂：荧胺→脂肪族或芳香族伯胺类；
邻苯二甲醛(OPA)→伯胺类及大多数氨基酸；
NBD→伯及仲类氨基酸，尤其是脯氨酸。
三.基因研究及检测
遗传物质的脱氧核糖酸(DNA),自身的荧光效率很低,一般条件下几乎检测不到DNA的荧光.因此,常选用某些荧光分子作为探针,通过探针标记分子的荧光变化来研究DNA与小分子及药物的作用机理,从而探讨致病原因及筛选和设计新的高效低毒药物。目前,典型的荧光探针分子为溴化乙锭(EB)。此外也使用钉的配合物等.在基因检测方面,已逐步使用荧光染料作为标记物来代替同位素标记,从而克服了同位素标记物产生的污染、价格昂贵及难保存等的不足。
